Negi Springfield, petit génie de la magie de 10 ans, termine ses études en Ecosse. Il ne lui reste qu'un stage à effectuer pour terminer officiellement son cursus. Il se retrouve professeur d'anglais dans un collège au Japon à la tête d'une classe de 31 filles. L'une d'entre elle, Asuna Kagurazaka, l'héberge à la demande du directeur. Mais ayant découvert le secret de Negi, elle le fait chanter.