Après avoir combattu à Troie et affronté les terribles Gorgones dans La Dernière Odyssée, Niréus se réfugie sur son île. Or celle-ci disparaît, enlevée par les Géants qui veulent provoquer la colère de Zeus. Pour reconquérir son royaume, le héros balafré prend les armes, aidé par ses fidèles compagnons, dont une farouche guerrière à l'épée noire et Héraclès, le plus fameux demi-dieu. Une course contre le temps s'engage car l'univers est en train de disparaître... Mais est-il encore temps de modifier le Destin ?