Blessé par un monstre, le jeune guerrier Ashitaka est obligé de quitter son village, pour chercher un remède. Il arrive dans une forêt où des animaux géants livrent une guerre sans merci aux humains des environs. C'est là qu'il rencontre San, la princesse Mononoke, une jeune fille élevée par des loups, qui voue une haine féroce aux humains.