New York, 1926. Une force mystérieuse sème le chaos dans les rues, menaçant de révéler l'existence de la communauté des sorciers. Au même moment, Norbert Dragonneau débarque dans la ville au terme d'un périple à travers le monde : il a répertorié un bestiaire d'animaux fantastiques dont certains sont dissimulés dans sa valise. Mais quand Jacob Kowalski, Non-Maj'qui ne se doute de rien, libère accidentellement quelques-unes de ces créatures, ils vont devoir s'unir pour les retrouver avant qu'il ne soit trop tard. Ces héros improbables ne se doutent alors pas que leur mission les mènera à affronter les forces des ténèbres.